آيت الله سيد محمد ابراهيم خوانساري يکي از علماي بزرگ اصفهان، در خانواده عالم پرور خوانسار به دنيا آمد. وي پس از طي مقدمات و سطوح علوم اسلامي، در حلقه درس عموي بزرگوار خويش سيد محمد باقر خوانساري معروف به صاحب روضات، شرکت جست و پس از سالها تلمذ در حلقه درس عالمان نامدار عصر به درجه عالي اجتهاد دست يافت. وي پس از آن به تدريس علوم اسلامي فقه و اصول پرداخت و شاگردان زيادي پرورش داد. ايشان همچنين مرجع تقليد جمع زيادي از شيعيان بود و تأليفات متعددي را به انجام رساند. ايشان مباحث و مناظراتي با علماي مسيحي در اثبات نبوت پيامبر بزرگ اسلام داشته و چون دانشمندان مسيحي استدلال او را نمي پذيرفتند آنها را به مباهله دعوت مي نمود ولي آنان حاضر به مباهله نمي شدند. اين فقيه وارسته و خدمتگذار دلباخته اسلام سرانجام در 12 فرورذين 1292ش. برابر با 23 ربيع الثاني 1331ق. در 60 سالگي وفات يافت و در کنار مزار عموي دانشمند خويش در اصفهان مدفون شد.