مسجد و مدرسه خازن‌الملک توسط حاجی‌‌محمدرحیم‌‌خان، ملقب به خازن‌‌الملک ایجاد شد. او که صندوق‌دار و رخت‌دار بیوتات سلطنتی دوره ناصرالدین شاه بود، این مسجد و مدرسه را در سال ۱۲۹۳ هجری قمری ایجاد کرد. پس از فوت، او را در این مسجد و مدرسه دفن کردند و حجاری سنگ قبر او یکی از زیباترین سنگ قبرهای مرمری تهران است.
این اثر تاریخی در مهر سال ۱۳۸۳ به شماره ۱۱۲۰۷ در فهرست آثار ملی کشور ثبت شد.