نخستين سيستم فايل استفاده شده در Mac OS سيستم فايل مکينتاش (Macintosh File System (MFS)) بود که تنها امکان استفاده از يک سطح پوشه را فراهم مي‌کرد. اين سيستم فايل در نسخه‌هاي بعدي، با سيستم فايل (Hierarchical File System (HFS) (سيستم فايل سلسله مراتبي) که داراي ساختار درختي مديريت فايل بود، جايگزين شد. در رابطه با سيستم فايل سيستم‌عامل مکينتاش بايد به نکته مهمي اشاره کرد که آن را از سيستم‌هاي فايل ديگر سيستم‌عامل‌ها متمايز مي‌کند. اکثر سيستم‌هاي فايل که توسط DOS، Unix يا ديگر سيستم‌عامل‌ها استفاده مي‌شوند، به سادگي فايل را بصورت يک سري از بايت‌هاي پيوسته در نظر مي‌گيرند بطوريکه هر فايل نياز به برنامه‌اي دارد که تشخيص دهد آن فايل حاوي چه اطلاعاتي است. برخلاف اين قاعده، MFS و HFS فايل را بصورت دو بخش مجزا (بخش داده و بخش منابع) در نظر مي‌گيرند.