مقام معظم رهبری بزرگترین اهداکننده نسخ خطی در کشور هستند که تاکنون تعداد 14 هزار نسخه خطی اعم از نفایس خطی و ... را به این مجموعه اهدا کردهاند.
توجه ویژه مقام معظم رهبری به حفاظت و نگهداری مطلوب آثار فرهنگی سبب شد تا ایشان به عنوان بزرگترین واقف کتب خطی بیش از 14 هزار نسخه کتاب خطی را به کتابخانه آستان قدس رضوی اهدا کنند. کتابهای اهدایی مقام معظم رهبری تاکنون به طور کلی 16 هزار نسخه بوده که دو هزار نسخه از این تعداد، چاپ سنگی است.
این کتب از کتابخانه شخصی علمای بزرگ از سوی مقام معظم رهبری خریداری شده و در اختیار آستان قدس رضوی قرار گرفته است. علاوه بر این، حجم هدایای ایشان به مرکز موزههای آستان قدس رضوی به اندازهای بوده که از سال 1373 گنجینهای ویژه به منظور نمایش هدایای رهبری ایجاد شده است.